日前，德国默克（Merck KGaA）宣布，该公司与Cyclica公司达成授权合作协议，将使用该公司名为Ligand Express的云端蛋白质组（proteome）筛选平台加快药物研发。Ligand Express是一种用人工智能（AI）辅助的基于分子结构的蛋白质组筛选平台，用于发现与小分子化合物结合的新靶点。这项合作将帮助德国默克高效率地揭示该公司一系列在研小分子化合物的作用机制，并且评估它们的安全性以及在其它方面的应用。
Cyclica公司是一家致力于利用计算生物物理学和AI技术来加快药物发现过程的生物技术公司。该公司的云端Ligand Express平台以小分子药物为中心，筛选能够与这些小分子药物相结合的所有蛋白靶点。同时利用AI来评估这些小分子药物对蛋白靶点的影响，并且使用生物信息学和系统生物学技术将药物与蛋白的互动关系呈现为图像。这一平台能够对小分子化合物进行独特的全面评估，发现很多预期或意外的药物-蛋白相互作用。这些信息可能帮助改善药物效力，或者预防药物的副作用。
▲Ligand Express平台示意图（图片来源：Cyclica公司官网）
“我们研发策略的关键是以最快速度高效推动具备潜力的化合物的研发过程，”德国默克计算化学和生物学主任Friedrich Rippmann先生说：“像Ligand Express这样的AI平台将提高我们对靶点发现的理解，辅助表型筛选和对脱靶效应的评估。”
“目前的蛋白筛选手段可能需要一年才能完成筛选过程，使用现有手段对多种化合物进行筛选耗时耗力。我们认为使用云端AI辅助技术能够提高药物开发过程的效率，”Cyclica公司总裁兼首席执行官Naheed Kurji先生说：“我们非常高兴德国默克能够利用Ligand Express平台来推动它们发现创新靶点的过程。”
参考资料：
[1] Merck KGaA, Darmstadt, Germany, in Agreement with Cyclica for AI-augmented Screening Platform to Expand Research Capabilities. Retrieved December 11, 2018, from https://www.prnewswire.com/news-releases/merck-kgaa-darmstadt-germany-in-agreement-with-cyclica-for-ai-augmented-screening-platform-to-expand-research-capabilities-801736521.html
[2] Cyclica. Retrieved December 11, 2018, from https://cyclicarx.com/